MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum F8 draft genome

Total Repeats: 38496

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021008	TGC	2	6	6156	6161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
2	NC_021008	TGA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134918
3	NC_021008	ATCA	2	8	6242	6249	50 %	25 %	0 %	25 %	479134918
4	NC_021008	GC	3	6	6285	6290	0 %	0 %	50 %	50 %	479134918
5	NC_021008	CGG	2	6	6304	6309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
6	NC_021008	CGG	2	6	6313	6318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
7	NC_021008	GGC	2	6	6341	6346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134918
8	NC_021008	TCG	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134918
9	NC_021008	TGG	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134918
10	NC_021008	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
11	NC_021008	CGC	2	6	6691	6696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
12	NC_021008	GGT	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
13	NC_021008	CG	3	6	6769	6774	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
14	NC_021008	CAC	2	6	6824	6829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134919
15	NC_021008	GCCG	2	8	6842	6849	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
16	NC_021008	CG	4	8	6848	6855	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
17	NC_021008	GAA	2	6	6860	6865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
18	NC_021008	CAT	2	6	6881	6886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
19	NC_021008	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
20	NC_021008	GTCG	2	8	6932	6939	0 %	25 %	50 %	25 %	479134919
21	NC_021008	CTC	2	6	6962	6967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
22	NC_021008	CTT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
23	NC_021008	CTG	3	9	7082	7090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
24	NC_021008	GCC	2	6	7142	7147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
25	NC_021008	GAC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134919
26	NC_021008	TCT	2	6	7186	7191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
27	NC_021008	CGG	2	6	7199	7204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
28	NC_021008	GTG	2	6	7221	7226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
29	NC_021008	TGG	2	6	7246	7251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
30	NC_021008	TCGGA	2	10	7255	7264	20 %	20 %	40 %	20 %	479134919
31	NC_021008	GCC	2	6	7328	7333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
32	NC_021008	GCG	2	6	7359	7364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134919
33	NC_021008	TGG	2	6	7384	7389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
34	NC_021008	CCG	2	6	7404	7409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
35	NC_021008	TGA	2	6	7414	7419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
36	NC_021008	GGA	2	6	7448	7453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134919
37	NC_021008	CTT	2	6	7493	7498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
38	NC_021008	GAA	2	6	7526	7531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
39	NC_021008	TCT	2	6	7549	7554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
40	NC_021008	ATC	2	6	7692	7697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
41	NC_021008	TGA	2	6	7758	7763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
42	NC_021008	TCA	2	6	7863	7868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134919
43	NC_021008	GAA	2	6	7871	7876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
44	NC_021008	GAA	2	6	7916	7921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134919
45	NC_021008	TGG	2	6	7999	8004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134919
46	NC_021008	AGT	2	6	8017	8022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
47	NC_021008	TCC	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134919
48	NC_021008	TTG	2	6	8034	8039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134919
49	NC_021008	AGT	2	6	8044	8049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
50	NC_021008	TCG	2	6	8052	8057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
51	NC_021008	GCC	2	6	8141	8146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
52	NC_021008	GCC	2	6	8192	8197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
53	NC_021008	GGATGT	2	12	8218	8229	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	479134919
54	NC_021008	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134919
55	NC_021008	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
56	NC_021008	ATGC	2	8	8305	8312	25 %	25 %	25 %	25 %	479134919
57	NC_021008	TTG	2	6	8313	8318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134919
58	NC_021008	CGGC	2	8	8326	8333	0 %	0 %	50 %	50 %	479134919
59	NC_021008	TTC	2	6	8334	8339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134919
60	NC_021008	GCT	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134919
61	NC_021008	GTA	2	6	8372	8377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134919
62	NC_021008	GAT	2	6	8597	8602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134920
63	NC_021008	CCATG	2	10	8622	8631	20 %	20 %	20 %	40 %	479134920
64	NC_021008	GAT	2	6	8687	8692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134920
65	NC_021008	GCA	2	6	8715	8720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134920
66	NC_021008	CTGC	2	8	8772	8779	0 %	25 %	25 %	50 %	479134920
67	NC_021008	CGT	2	6	8780	8785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134920
68	NC_021008	TTCGG	2	10	8788	8797	0 %	40 %	40 %	20 %	479134920
69	NC_021008	CGAT	2	8	8836	8843	25 %	25 %	25 %	25 %	479134920
70	NC_021008	GCCTT	2	10	8848	8857	0 %	40 %	20 %	40 %	479134920
71	NC_021008	TTG	2	6	8949	8954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134920
72	NC_021008	GTT	2	6	8964	8969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134920
73	NC_021008	GGC	2	6	9112	9117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
74	NC_021008	AGC	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
75	NC_021008	AAC	2	6	9158	9163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134921
76	NC_021008	GAT	2	6	9261	9266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
77	NC_021008	CAT	2	6	9289	9294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134921
78	NC_021008	CGG	2	6	9316	9321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
79	NC_021008	TGA	2	6	9327	9332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
80	NC_021008	TCG	2	6	9401	9406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
81	NC_021008	CGG	3	9	9456	9464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
82	NC_021008	GAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134921
83	NC_021008	TGGA	2	8	9497	9504	25 %	25 %	50 %	0 %	479134921
84	NC_021008	CTT	2	6	9547	9552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
85	NC_021008	CTG	2	6	9598	9603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
86	NC_021008	AAGTT	2	10	9731	9740	40 %	40 %	20 %	0 %	479134921
87	NC_021008	TCT	2	6	9744	9749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
88	NC_021008	CAC	2	6	9868	9873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
89	NC_021008	GGC	2	6	9883	9888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
90	NC_021008	AGC	2	6	9902	9907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
91	NC_021008	GC	3	6	9906	9911	0 %	0 %	50 %	50 %	479134921
92	NC_021008	CGG	2	6	9995	10000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
93	NC_021008	CG	3	6	10029	10034	0 %	0 %	50 %	50 %	479134921
94	NC_021008	GAT	2	6	10051	10056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
95	NC_021008	GAC	2	6	10108	10113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
96	NC_021008	GCG	2	6	10180	10185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
97	NC_021008	GTCTT	2	10	10208	10217	0 %	60 %	20 %	20 %	479134921
98	NC_021008	TGG	2	6	10221	10226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
99	NC_021008	CAA	2	6	10237	10242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134921
100	NC_021008	GGC	2	6	10243	10248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
101	NC_021008	GCG	2	6	10310	10315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
102	NC_021008	TTG	2	6	10325	10330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134921
103	NC_021008	GAA	2	6	10414	10419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134921
104	NC_021008	CTT	3	9	10450	10458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
105	NC_021008	GCA	2	6	10473	10478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
106	NC_021008	GCG	2	6	10517	10522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
107	NC_021008	GAT	2	6	10543	10548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
108	NC_021008	CTC	2	6	10585	10590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
109	NC_021008	TCT	2	6	10614	10619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
110	NC_021008	CGGT	2	8	10675	10682	0 %	25 %	50 %	25 %	479134921
111	NC_021008	CAG	2	6	10735	10740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
112	NC_021008	CTC	2	6	10785	10790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134921
113	NC_021008	TTC	2	6	10871	10876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
114	NC_021008	GAT	2	6	10888	10893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
115	NC_021008	GGT	3	9	10963	10971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
116	NC_021008	ATG	2	6	11030	11035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
117	NC_021008	CTT	2	6	11088	11093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134921
118	NC_021008	GGC	2	6	11164	11169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
119	NC_021008	GCC	2	6	11203	11208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134921
120	NC_021008	GCC	2	6	11213	11218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134921
121	NC_021008	T	6	6	11238	11243	0 %	100 %	0 %	0 %	479134921
122	NC_021008	ATG	2	6	11267	11272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
123	NC_021008	CGC	2	6	11355	11360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134921
124	NC_021008	CGGCC	2	10	11528	11537	0 %	0 %	40 %	60 %	479134921
125	NC_021008	CCA	2	6	11538	11543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
126	NC_021008	CAC	2	6	11622	11627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134921
127	NC_021008	GCG	2	6	11658	11663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134921
128	NC_021008	CGT	2	6	11670	11675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
129	NC_021008	T	6	6	11701	11706	0 %	100 %	0 %	0 %	479134921
130	NC_021008	GTC	2	6	11776	11781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134921
131	NC_021008	GGT	2	6	11835	11840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134921
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133	NC_021008	GTA	2	6	11878	11883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134921
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152	NC_021008	AGC	2	6	12608	12613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134921
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258	NC_021008	CGC	2	6	19617	19622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134930
259	NC_021008	ATGT	2	8	19644	19651	25 %	50 %	25 %	0 %	479134930
260	NC_021008	GAA	2	6	19654	19659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134930
261	NC_021008	AT	3	6	19670	19675	50 %	50 %	0 %	0 %	479134930
262	NC_021008	CTTG	2	8	19724	19731	0 %	50 %	25 %	25 %	479134930
263	NC_021008	AAT	2	6	19893	19898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134931
264	NC_021008	TAC	2	6	19932	19937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
265	NC_021008	AG	3	6	19976	19981	50 %	0 %	50 %	0 %	479134931
266	NC_021008	TTG	3	9	19983	19991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	479134931
267	NC_021008	GTC	2	6	20136	20141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134931
268	NC_021008	TTC	2	6	20170	20175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134931
269	NC_021008	CCA	2	6	20188	20193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134931
270	NC_021008	TCAA	2	8	20236	20243	50 %	25 %	0 %	25 %	479134931
271	NC_021008	GCG	2	6	20375	20380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479134931
272	NC_021008	TGA	2	6	20381	20386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134931
273	NC_021008	CAA	2	6	20408	20413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479134931
274	NC_021008	CTT	2	6	20532	20537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134931
275	NC_021008	ATC	2	6	20589	20594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
276	NC_021008	TCA	2	6	20632	20637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
277	NC_021008	CAGC	2	8	20648	20655	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
278	NC_021008	TCA	2	6	20665	20670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
279	NC_021008	CAT	2	6	20684	20689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
280	NC_021008	ATC	2	6	20692	20697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
281	NC_021008	GGA	2	6	20712	20717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479134931
282	NC_021008	TCA	2	6	20746	20751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
283	NC_021008	CCGT	2	8	20800	20807	0 %	25 %	25 %	50 %	479134931
284	NC_021008	TCAT	2	8	20812	20819	25 %	50 %	0 %	25 %	479134931
285	NC_021008	GTC	2	6	20824	20829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134931
286	NC_021008	GCA	2	6	20839	20844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134931
287	NC_021008	GAATC	2	10	20850	20859	40 %	20 %	20 %	20 %	479134931
288	NC_021008	CGC	2	6	20877	20882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134931
289	NC_021008	GCA	2	6	20911	20916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134931
290	NC_021008	CACG	2	8	20923	20930	25 %	0 %	25 %	50 %	479134931
291	NC_021008	GAA	2	6	20945	20950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134931
292	NC_021008	ATC	3	9	20961	20969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
293	NC_021008	ACC	2	6	21037	21042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134931
294	NC_021008	CGC	2	6	21068	21073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479134931
295	NC_021008	CAT	2	6	21116	21121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
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299	NC_021008	CAAC	2	8	21284	21291	50 %	0 %	0 %	50 %	479134931
300	NC_021008	TGA	2	6	21343	21348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134931
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303	NC_021008	ACG	2	6	21415	21420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134931
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321	NC_021008	GCCGA	2	10	22297	22306	20 %	0 %	40 %	40 %	479134931
322	NC_021008	TCA	2	6	22352	22357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
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327	NC_021008	GAAT	2	8	22559	22566	50 %	25 %	25 %	0 %	479134931
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330	NC_021008	GCT	2	6	22649	22654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134931
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332	NC_021008	CTG	2	6	22728	22733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134931
333	NC_021008	GTG	2	6	22741	22746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479134931
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335	NC_021008	TCA	2	6	22786	22791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134931
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352	NC_021008	CAG	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134931
353	NC_021008	TGA	2	6	23906	23911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134931
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356	NC_021008	CA	4	8	27429	27436	50 %	0 %	0 %	50 %	479134932
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361	NC_021008	TCT	2	6	27809	27814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
362	NC_021008	ATA	2	6	27910	27915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134932
363	NC_021008	GATT	2	8	27920	27927	25 %	50 %	25 %	0 %	479134932
364	NC_021008	TTC	2	6	27967	27972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
365	NC_021008	CTG	2	6	28165	28170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134932
366	NC_021008	TCCA	2	8	28189	28196	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
367	NC_021008	AC	3	6	28239	28244	50 %	0 %	0 %	50 %	479134932
368	NC_021008	CAC	2	6	28324	28329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479134932
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371	NC_021008	AT	3	6	28498	28503	50 %	50 %	0 %	0 %	479134932
372	NC_021008	CTT	2	6	28531	28536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
373	NC_021008	CAG	2	6	28653	28658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479134932
374	NC_021008	CCGTT	2	10	28717	28726	0 %	40 %	20 %	40 %	479134932
375	NC_021008	TTC	2	6	28915	28920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479134932
376	NC_021008	GAA	2	6	29025	29030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134932
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378	NC_021008	ATA	2	6	29194	29199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	479134932
379	NC_021008	CTC	2	6	29200	29205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479134932
380	NC_021008	CCAT	2	8	29231	29238	25 %	25 %	0 %	50 %	479134932
381	NC_021008	CAT	2	6	29268	29273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134932
382	NC_021008	TCA	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479134932
383	NC_021008	ATG	2	6	30141	30146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479134933
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385	NC_021008	CTG	2	6	30207	30212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479134933
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500	NC_021008	GAA	2	6	43519	43524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479134938

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